生命科学

GC含量計算

DNA配列に含まれるGとCの割合を求め、塩基組成を確認します。

構成を図で確認

塩基組成

計算待ち

全塩基数: —
GC: —
AT: —
除外ヘッダー: —

A —T —G —C —

各塩基の割合を配列全体に対する比率で示します。

計算すると塩基組成を表示します。

計算方法

GC含量と塩基組成

GC (%) = (G + C) / (A + T + G + C) × 100GC含量

AT (%) = (A + T) / (A + T + G + C) × 100AT含量

入力の扱い

大文字と小文字は区別しません。
行頭が「>」のFASTAヘッダーと空白文字は塩基数に含めません。
N、U、IUPAC曖昧塩基など、A・C・G・T以外の文字はエラーにします。