生命科学

DNA・RNA塩基組成

DNAまたはRNA配列の各塩基数と構成比を確認します。曖昧塩基は推定せず、別に表示します。

計算

配列を入力

配列の種類

大文字と小文字は区別しません。空白とFASTAヘッダー行を除外します。DNAモードはT、RNAモードはUを使います。

計算結果

配列を確認して計算してください。

計算方法

塩基組成と曖昧塩基

GC (%) = (G + C) / L × 100確定したGとCの割合
AT (%) = (A + T) / L × 100DNAはAT、RNAはAUを表示

入力の扱い

  • 大文字と小文字は区別しません。
  • 空白と行頭が「>」のFASTAヘッダー行は除外します。
  • IUPAC曖昧塩基は別に数え、正規塩基へ推定配分しません。
  • DNAのU、RNAのT、混在したT/U、記号、品質値はエラーにします。